Я знаю много таких бяк, которые делают плохую вещь и ставят софт на сервер через make install. Особенно это огорчает, если ставят какой-нибудь nginx (пытаешься поставить его потом из пакета — и удаляешь по кусочкам ходишь). Потому что папки с исходниками уже нет, и make unistall сделать нельзя.
В итоге на сервере получается бардак, софт не обновляется, обрастает известными уязвимостями. И в один прекрасный момент от крона вам приходит письмо вида «chown root.root /tmp/sh && chmod +x /tmp/sh: sucessfully done», а через пару часов хостер банит ваш сервер за исходящую ддос атаку.

Данную проблему призвана решить утилита checkinstall.
Поставим её:

И запоминаем навсегда, что вместо make install мы делаем checkinstall, а потом ставим получившийся deb-пакетик.

Обычно на это и заканчиваются все мануалы по checkinstall’у. Но инструмент куда умнее, чем кажется на первый взгляд. Во-первых, он умеет собирать RPM-пакеты, deb-пакеты и slackware пакеты (ключи -R/-D/-S, соответственно). По умолчанию ставится ключ, соответствующий вашему пакетному менеджеру. Ебилды не умеет, да =)

Во-вторых у него есть ключ --install, который сразу установит созданный пакет.

Пакеты могут быть названы вполне аккуратно при помощи ключей --pkgname и --pkgversion. Тогда они вообще прекрасно вклинятся в базу dpkg.

Полезной может стать опция --nodoc (зачем хранить документацию на каждом сервере?)

Если вы собираете библиотеку (или что-либо, содержащее shared-libs) — вам будет полезна опция --addso (тогда при установке пакет добавит записи в /etc/ld.so.conf).

Нередко будет полезной опция --reset-uids — ставит chmod 755 на все файлы и chown root:root на все каталоги.

В итоге, вместо make install, стоит делать примерно следующее: